1917年初，陈独秀应蔡元培校长之邀，从上海来到北京就任北大文科学长，《新青年》编辑部随之迁址入京，其所在地就在东城区北池子大街箭杆胡同9号院。

　　《新青年》创刊之初，陈独秀个人担任主编，安徽籍的朋友撰稿予以支持。陈独秀北大任职后，北京大学内具有先进思想的新派人物加入编辑阵营。从四卷一号起，《新青年》成为北大同人刊物，“一校一刊”的结合，更加突显新文化运动“民主”、“科学”的宗旨。

　　陈独秀编辑的四卷一号开始使用白话文和新式标点；钱玄同承担了四卷二号的编辑责任。《旧邦新命——新文化运动百年纪念展》中的《钱玄同日记》手稿，明确记录了《新青年》杂志由主要同人轮值编辑的史实：

　　1918年1月2日：“午后至独秀处，检得《新青年》存稿。因四卷二号归我编辑，本月五日须编稿，十五日须寄出也。”

　　1918年1月12日：“独秀交来《新青年》用稿一篇，题为《人生真义》，约千八百字左右，做得很精。又李守常论《俄国革命与文学》一稿，可留为第三号用。”

　　1918年1月21日：“《新青年》四卷一号已寄到。居然按Jan.15之期出版，其中所用新式圈点居然印得很像样子，可喜可喜。”

　　从1918年1月四卷一号起，到1919年11月六卷六号止，《新青年》共有3卷18期由编辑部同人轮值编辑。主要编辑者有陈独秀、钱玄同、刘半农、胡适、沈尹默、陶孟和、李大钊、高一涵。从七卷一号起，《新青年》再度恢复到陈独秀个人主撰的状态。《新青年》作为民国史上第一同人刊物的历史也就此终结。